Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 4933417G07Rik-201ENSMUST00000199681 1137 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC140449.1-201ENSMUST00000214600 1459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trim35Q8C006 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trim35Q8C006 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trim35Q8C006 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28405-201ENSMUST00000185222 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29255-201ENSMUST00000185248 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29421-201ENSMUST00000185843 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29248-201ENSMUST00000186074 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28207-202ENSMUST00000187419 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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