Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kdm4aQ8BW72 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kdm4aQ8BW72 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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