Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Pggt1bQ8BUY9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pggt1bQ8BUY9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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