Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms