Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf41Q8BH75 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms