Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.4Q85ZW8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms