Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3cQ80U95 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ube3cQ80U95 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms