Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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