Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf7ipQ7TT18 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf7ipQ7TT18 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms