Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms