Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nphp3Q7TNH6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms