Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnih3Q6ZWS4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms