Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp8b3Q6UQ17 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms