Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mfsd13aQ6PDE8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms