Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nop58Q6DFW4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms