Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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