Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pkp4Q68FH0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkp4Q68FH0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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