Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Foxd4Q60688 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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