Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tsr1Q5SWD9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tsr1Q5SWD9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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