Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
H2al1nQ497L1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
H2al1nQ497L1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms