Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Fam220aQ3ZN08 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fam220aQ3ZN08 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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