Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc43Q3V0L5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms