Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Chpf2Q3UU43 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Chpf2Q3UU43 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chpf2Q3UU43 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chpf2Q3UU43 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chpf2Q3UU43 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chpf2Q3UU43 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms