Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms