Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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