Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q3U6N9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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