Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U595 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U595 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms