Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms