Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms