Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Calb2Q08331 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms