Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms