Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms