Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs2Q03350 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms