Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms