Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HmgcrQ01237 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HmgcrQ01237 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms