Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gjb2Q00977 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms