Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoa1Q00623 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms