Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax8Q00288 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms