Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms