Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SmsP97355 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SmsP97355 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms