Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cbx1P83917 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cbx1P83917 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms