Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr4P70658 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cxcr4P70658 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms