Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb13P70321 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb13P70321 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms