Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms