Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SbdsP70122 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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