Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Crip1P63254 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms