Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UbdP63072 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UbdP63072 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
UbdP63072 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UbdP63072 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms