Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhobP62746 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RhobP62746 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RhobP62746 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
RhobP62746 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
RhobP62746 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms