Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdhd1P59328 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms