Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gp1bbP56400 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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